Wackelkontakt oder dgl.. Da bricht entweder die 24Volt Spannung ein oder schließt kurzfristig kurz gegen Masse oder sowas perverses.
Nim mal die Versorgung vom Y-Motor unter die Lupe. Auch den Schrittmotortreiber von der Y-Achse mit dem SMT von der X - Achse tauschen ob der Fehler dann wandert auf die andere Achse.